回到游戏3代故事结尾，在南极洲的失落之城陨坑深处，那个凶猛女人劳拉成功打败了邪恶博士威拉德，终结了他的一系列疯狂阴谋。事后的劳拉在雪地外面站着，或许还在独自回想着发生的一切。
突然看到了威拉德远远地从陨石坑出现，博士竟然又从不朽生物（大蜘蛛怪）形态变回了人类，不过痛苦不堪的没等做什么，博士笑了声就倒下领盒饭去了，此处应默哀三秒。一直为主角苦口婆心科普背景来龙去脉的好人威拉德，凭借什么精神又坚持了三秒钟？劳拉走了过去，默默翻出来一个钱包，当然钱不是重点，因为里面还有一封给博士的电报。通知陨石的第五碎片已找到，送到了博士尼斯湖畔的城堡里。游戏之前就埋了个坑，劳拉集齐四件陨石碎片后发生共振，会按五边形规则排列。
劳拉坐着直升机来到了著名的尼斯湖水怪故乡，当然也是威拉德的家。从苏格兰的高地庭院劳拉一路打砸到屋里，再打到一票成为试验品的生化人，把威拉德的巢穴翻了个底朝天，但是保险箱里陨石碎片已经被捷足先登抢走了，还好劳拉通过宝箱里流出的绿色液体发现了线索。
英国的多佛港因为绿色液体引发隧道爆炸，劳拉知道是对方在作妖又乘坐直升机赶了过来。这附近有英国著名的莎士比亚绝壁，就是英吉利海岸线的白色绝壁风景，英国的影视剧作品经常出现。之后剧情发展光从故事角度看其实更接近007，被雕刻成手掌的陨石碎片也是数次争夺易手，3代游戏也经常被认为是旧系列游戏里难度最高的。劳拉一路潜入杀进英法海底隧道，又摸进敌人的海底秘密基地。劳拉还在水底大战潜艇，导致潜艇撞了附近水雷而爆炸，又捡回碎片的劳拉就这么一路地来到了法国，爬上地面就到了首都最古老建筑之一的巴黎动物园。
劳拉在历经了英法由北到南的观光旅行后，在巴黎终于遇到了幕后黑手，也是老朋友了，前不久刚打劫了一遍的索菲亚，劳拉之前就是从她手里夺走的一块碎片。没想到这次索菲亚不死心趁机出来抢跑了第五块碎片，劳拉接着一路追，又打倒不少实验生化人。最后BOSS索菲亚依旧不敌劳拉，被迫永久告别离场，主角则最后带上陨石碎片乘上了热气球，3代故事到此完结。
